Вот такое решение нашел для скрытия помеченных на удаление групп в динамическом списке иерархического справочника.

Открываем настройки списка


open

Добавляем условие в условное оформление


if

Устанавливаем видимость Ложь


deleted

В поле Условие добавляем два условия: Это группа и Пометка удаления


otbor

Оформляемые поля оставляем пустые


empty